本剧讲述了卢修、凯拉、杰名、欧泽四位少年，借助量子隧道穿梭于地球与太古星城之间，与星城特工携手寻找核心能源“太古晶核”，以重启量子核心、守护和平的冒险故事。途中，他们屡遭司徒影及其手下蒙洛洛、涂煞的阻挠，对方动用科技恐龙、机械虫等种种手段发动袭击，意图抢夺晶核。量子战队凭借智慧与勇气不断升级装备、团结协作，更在伙伴紫露、齐嘟嘟和路迪的援助下，突破重重危机，最终成功集齐晶核，守护了太古星城的安危。
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」，被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后，恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
