《动物兄弟》第六季继续讲述克里斯和马丁两兄弟携手伙伴阿维娃、科基、吉米，驾着海龟船踏上环游世界的探险之旅，揭开各地动物的奥秘，守护动物家园。兄弟俩依靠先进的高科技装备与专属的动物超能力服，在旅程中把遇到的动物所展现出的奇特能力转换为“动物超能力碟”，从而让自己变身为各种动物形态，完成救援任务、对抗反派势力。